宝德助地坛医院抗击埃博拉

 日前,宝德在首都医科大学附属医院北京地坛医院(简称“地坛医院”)埃博拉出血热病例应急设备采购项目中一举中标,为客户量身定做的包括硬件建设、系统建设、软件建设与技术服务在内的HPC集群解决方案,为地坛医院在埃博拉病毒检测以及后期病原检测方面的研究提供了高计算能力、高性能、高存储的计算平台,加快了地坛医院提升埃博拉病毒检测、病原检测等生命科学科研水平的步伐。

地坛医院始建于1946年,是北京市卫生局直属三级甲等医院,也是北京大学医学部、北京中医药大学教学医院。国家肝病、艾滋病临床药物验证基地、国家中医药管理局中西医结合传染病临床基地均设于此。医院主要承担除结核病以外的39种法定传染病的诊治、研究和培训任务,是一家集医疗、教学、科研、预防为一体的公共卫生临床医疗机构。

2014年8月埃博拉病毒肆虐非洲,疫情瞬息万变。地坛医院第一批援几内亚医疗队于8 月12日两小时内集结完毕赶赴西非。针对可能发生的埃博拉出血热疫情传入风险,北京市卫生计生委指定地坛医院为埃博拉出血热定点收治医院。中国虽然没有发现埃博拉病毒患者,但是疑似患者入院治疗的情况还是屡有发生。为防止埃博拉病毒入侵我国,地坛医院启动了埃博拉出血热病例应急设备的采购。

通过对客户背景与应用需求的深入分析,结合以往在生物信息与生命科学领域HPC方面的成功案例,宝德最终为客户确定了基于宝德生物一体机PowerScale8000-B高性能计算机集群系统的解决方案。宝德PowerScale8000-B是一套应用于生物信息计算的一体机,能为客户在序列比对、序列拼接、GPU 加速方面提供更的高性能保证;它使用目前业界先进的软件定义存储,在安全、性能、管理方面能发挥极致性能。

宝德PowerScale8000-B高性能计算机集群系统

宝德PowerScale8000-B高性能计算机集群系统作为埃博拉病毒检测以及地坛医院后期病原检测的主要计算单元,配合高通量测序仪一起完成地坛医院埃博拉病毒应急设备项目,每次要满足测序仪>150亿(15G)碱基数据的计算,并且每次对>2000 万个片段序列的数据的分析,要满足98%以上的原始数据的准确性。为此,宝德为客户设计了一套拥有10.49万亿次计算能力的HPC集群整体解决方案。该方案网络部分采用双网分离结构,包括管理网和计算网两部分,管理网使用一台千兆交换机实现对所有节点的正常管理;计算网使用超低延迟核心万兆以太网交换机作为数据传输通路,保证数据的无阻塞、高效快速转发,以便更快地计算出数据结果。存储部分设计了一套分布式的海量存储系统,整套系统可提供70TB的可使用空间、800MByete/s的实际使用带宽,以及60万/s的IOPS 并发访问数,以保证数据调用的畅通无阻。

事实上,此次与地坛医院的合作只是宝德HPC解决方案在生命科学行业成功应用的一个缩影,此前,宝德与华大基因、中国科学院北京生命科学院、中国疾病监控中心、嘉宝仁和医疗有限公司等行业客户在生命科学研究领域展开了全面合作,在该领域积累了大量的客户与行业经验。其中,与华大基因的多次合作更是缔造了宝德高性能服务器PowerScale绘制全球第一张“黄种人基因图谱”、宝德Power Cluster8000HPC计算机系统绘制大熊猫基因两座里程碑。

波士顿咨询公司(BCG)发布的报告显示,中国医疗科技市场将在2013 年至2020 期间保持14%的年均增长率,到2020 年,市场规模将增至550亿美元,成为全球第二大医疗科技市场。报告预测,到2020年,中国医疗科技市场将超越日本和德国,从2013 年的世界第四位跃升至第二位,占据全球市场份额的13%。目前,国内医疗科研市场HPC应用正处于起步阶段,许多国产服务器厂商在医疗科研市场表现乏力,医疗科研市场存在大范围空白。长期以来,宝德一直致力于国内HPC的应用与普及,凭借在HPC领域的深入研究,宝德大力开拓医疗科研市场,在该领域积累了深厚的经验,填补了医疗科研市场HPC应用的空白,并为加快我国医疗科研领域的研究成果落地转化做出了突出的贡献

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